Ondsindet kode

Det er år 2034, og gymnasieeleven Sasaki Hiiro stiger ombord på sin bus ligesom enhver anden dag. Alt ændrer sig dog, da hans bus pludselig bliver angrebet af en mystisk pige med røde øjne. Da Hiiro vågner, befinder han sig i "Tokyo", en by, der skulle have været permanent lukket efter udbruddet af den dødelige Pandora-virus for ti år siden. Ikke kun det, men det ser også ud til, at alle dem, der er samlet i "Tokyo", udvikler nye umenneskelige evner. Nu, blandt ruinerne af Shibuya, skal Hiiro og hans venner opdage, hvorfor de er her og lære alt, hvad de kan, om den frygtelige ondsindede kode, der løber løbsk i deres kroppe, før den ødelægger dem alle!