Kanons historie, der foregår midt om vinteren, vedrører en gruppe på fem piger, der er forbundet tilbage til den samme dreng. Yuichi Aizawa, hovedpersonen, havde besøgt byen, hvor historien finder sted syv år før historiens begyndelse.
I begyndelsen er Yuichi meget løsrevet fra byen og dens indbyggere. Før hans tilbagevenden er det besluttet, at han skal bo hos sin fætter, Nayuki Minase, og hendes mor, Akiko. Efter hans lange fravær har Yuichi glemt næsten alt undtagen mindre detaljer om, hvad der skete syv år før og har brug for at blive mindet om, hvad han efterlod.
Dagen efter Yuichis tilbagevenden er han ude med Nayuki, der viser ham rundt i byen. Nayuki husker, at hun er nødt til at købe ting til middag, og Yuichi er tilbageholdende med at gå med hende og argumenterer for, at han kan gå tabt. Øjeblikke efter, at Nayuki lod ham vente på fortovet, springer en mærkelig pige ved navn Ayu Tsukimiya ind i ham med lidt advarsel. Da hun kom sig, trækker hun ham væk til en nærliggende café og indrømmer utilsigtet at stjæle en pose fyldt med taiyaki efter at være blevet skræmt væk af sælgeren, før hun havde en chance for at betale. Yuichi trækker derefter Ayu tilbage til sælgeren, de undskylder begge for ulykken, og Ayu tilgives. De beslutter at mødes igen en anden dag, og Ayu snyder sig væk.
Yuichi ved ikke først, men tre andre piger, som han havde glemt, kender ham. I historien, når han lærer om byens overnaturlige undertoner, mindes Yuichi om hver pige og begivenhederne for syv år siden i byen dækket af sne.
