Historien foregår før Mobile Suit Zeta Gundam, og historien følger Titans Test Team, Black Otter Team, på deres mission for at teste nye mobildragter til Titans. Det begynder med, at Eliard Hunter, en mobil dragtpilot fra Earth Federation, bliver tildelt Titans og overføres til Aswan, et Alexandria-klasseskib. Der møder han Carl Matsubara, en anden ny rekruttering af Titans, Audrey April, en dygtig pilot og chef for testoperationer og dataindsamling, og Wes Murphy, en veteran fra etårskrigen og Delaz-konflikten. Black Otter-holdet udfører ikke bare testløb, det deltager også i rigtige kampmissioner mod Zeon Remnants og senere mod AEUG.
