Resumé
D.Gray-man følger den 15-årige Allen Walkers eventyr, hvis venstre arm kan forvandle sig til en monstrøs klo og ødelægge akuma, udviklende maskiner skabt af Millennium Earl for at hjælpe ham med at ødelægge menneskeheden. Som beordret af sin mester General Cross Marian bliver Allen en eksorcist, folk der kan ødelægge akuma, for Black Order, en organisation, der forsøger at stoppe jarlen. Han bliver et magtfuldt aktiv for ordenen, fordi han kan opdage forklædt akuma med sit venstre øje. Allen bliver sendt for at genvinde stykker af Innocence, et stof, der giver visse mennesker, kaldet eksorcister, evnen til at ødelægge akuma. Jarlen beslutter sig for at kalde familien Noah sammen, overmenneskelige efterkommere af Noah, som kan ødelægge Innocence. Begge sider starter søgen efter Det Store Hjerte, det mest magtfulde stykke Innocence, der vil sikre sejr til den side, der finder det.