Resumé
Hvert 30. år vælges en ny prinsesse fra Hime-familien til at tjene Hayagami. Tiden er kommet igen, men i løbet af de seneste år viser optegnelser, at der ikke er født en eneste kvinde, bortset fra en, den 15-årige Arata. Det eneste problem er, Arata er faktisk en mand! Tvunget til at skjule sig og tage plads til prinsessekandidaten, indtil en formel kan findes, deltager han kun i festivalen for at være vidne til den nuværende prinsesse, Kokuri-hime, myrdet, og hans eget liv fortabes også af hænderne på prinsessens personlige vagt, den 12 Shinshou. Mens han løber for sit liv, overbeviser Kannagi af de 12 alle om, at Arata er den, der i stedet har myrdet prinsessen, og nu er alle i kejserlige domstol efter hans hoved! Vi skifter derefter over til Arata, en 15-årig skoledreng fra det moderne Japan, der har en utrolig atletisk evne, men er plaget af mobbere. Efter at Arata fra oldtiden løber ind i en mystisk skov, og Arata fra moderne tid løber ind i en gyde, tager de to på mystisk vis hinandens plads.